Программный комплекс "Ident Smart Studio" представляет собой экспертную систему, работающую в следующих режимах: режим предметно-независимого анализа образов комплексных экосистем и режим по анализу биологических объектов в рамках экосистемы, позволяющий исследователям анализировать объекты с существенно большей скоростью и точностью, чем при ручном анализе.

Комплекс состоит из базового ядра (механизм распознавания образов, формирование информационной базы, мастер скриптов, визуализация объекта в 3D-пространстве) и набора дополнительных модулей, которые имеют свою специализацию.

Отличительная особенность системы: отсутствие привязки к предметной области. Это открывает перед исследователями огромные возможности.